国务院总理温家宝6月29日到30日前往江苏无锡，在太湖的自来水取水口实地调查，视察污水处理厂、泵站和一些企业的治污情况。

6月30日，在集合了江苏、浙江、上海、安徽、云南等省市和国务院有关部门负责人的太湖、巢湖、滇池治理座谈会上，温家宝强调，三湖治理工程是“在生态环境方面，我们对人民以至对人类负责的一个表现”。

太湖的水质变化主要由蓝藻引起。监测数据显示：今年入夏以来，无锡市区域内的太湖水位出现50年以来最低水位，加上天气连续高温少雨，太湖水富营养化较重。此前的5月29日开始，蓝藻的提前暴发已影响了无锡城区自来水水源地水质，致使市民家中自来水无法正常饮用。

相比太湖，5月以来，云南滇池的蓝藻暴发并未影响昆明市民的饮用水。据悉，3月25日以后，昆明市民全部饮用水均来自新建成的掌鸠河引水供水水源工程云龙水库。另外，因为今年雨水较为充足，滇池蓝藻的暴发相比去年同期程度略轻。

安徽巢湖蓝藻侵害程度相对较低，没有形成大面积暴发。但是巢湖的水体中氮磷等营养物质已经具备了蓝藻疯长的条件，只要光线和温度合适，随时都有大面积暴发的可能。所以对于安徽环保部门来说，关注水质变化，加大对企业排污的监管是关键。

据专家介绍，蓝藻在生长过程中、能大量吸收水中的、有机污染物，净化水体。它只是死亡后会腐烂分解，加重水体污染。因此，目前对蓝藻的生长发展以及风向、水位、气温等自然环境进行实时监控的同时，太湖方面，每天会打捞蓝藻1000多吨。无锡市还将在两年内关闭规模以下化工企业772家。6月27日获悉，复旦大学“绞杀”太湖蓝藻的多种方法在实验室阶段也已经研究成功。